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- Bioinformatic tools in the study of ancient dogs: preliminary results of an Iberian case studyPublication . Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Guimarães, Silvia; Cardoso, João Luís; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Ginja, Catarina; Fernández-Rodríguez, Carlos; Ferreira, Eduardo; Pires, Ana ElisabeteIn this study, we attempted to carry out a genomic amplification of ancient DNA from four pre-historic Iberian dogs using the Illumina sequencing method; to assign mtDNA sequences to the major dog haplogroups and to characterize some phenotypic traits of these dogs.
- Unraveling the genomes of ancient Iberian CanisPublication . Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Cardoso, João Luís; Fernández-Rodríguez, Carlos; Sousa, Ana Catarina; Moreno-García, Marta; Guimarães, Sílvia; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Gotherstrom, Anders; Ginja, Catarina; Pires, Anabela Elisabete
- A alimentação em Lisboa no decurso da Idade do Ferro : resultados das escavações realizadas no Núcleo Arqueológico da Rua dos Correeiros (Lisboa, Portugal)Publication . Detry, Cleia; Cardoso, João Luís; Bugalhão, JacintaAs escavações efectuadas no subsolo da baixa de Lisboa, no Núcleo Arqueológico da Rua dos Correeiros, permitiram a identificação de diversos contextos arqueológicos, de carácter habitacional e artesanal, dos séculos V a inícios do IV a.C. Esses contextos forneceram um assinalável conjunto de restos mamalógicos e malacológicos. No caso dos mamíferos, a maioria dos elementos são de animais domésticos (vaca, ovelha, cabra, porco, cavalo e cão), com uma reduzida representação de animais caçados (veado). Também a presença de moluscos demonstra a utilização de recursos aquáticos. Estes resultados permitem sobretudo a reconstituição da dieta alimentar e, por via dela, das características económicas e até sociais do respectivo segmento da população que então ocupava a área ribeirinha da urbe.
- Iberian Chalcolithic Canis: a genomic approach to know them betterPublication . Blaschikoff, Ludmilla; Serra, Octávio; Guimarães, Sílvia; Cardoso, João Luís; Simões, Fernanda; Detry, Cleia; Ginja, Catarina; Fernández-Rodríguez, Carlos; Ferreira, Eduardo; Pires, Anabela ElisabeteTo our knowledge, for Iberian ancient dogs and wolves, this is the first attempt to successfully apply NGS methods.
- Estratégias alimentares dos animais domésticos do povoado de Leceia (Oeiras, Portugal) durante a transição do 4.º para o 3.º milénio a.C.: uma abordagem a partir dos isótopos estáveisPublication . Navarrete, Vanessa; Cardoso, João Luís; Dias, Cristina Barrocas; Detry, Cleia; Curto, Ana; Waterman, Anna J.; Wright, Elizabeth; Maurer, Anne‑FranceIn this article, we analyse faunal samples from the Late Neolithic (Layer 4) and Early Chalcolithic (Layer 3) levels of the fortified settlement of Leceia (Oeiras, Portugal) in order to understand the management of the feeding of domestic animals recovered in these excavations. Through the analyses of stable isotopes of δ13C and δ15N in bone collagen, we aim to characterise the grazing systems and the maintenance strategies of the livestock that were consumed and raised in Leceia, in an attempt to obtain a further perspective on the economic complexity of the fortified settlements that emerged during the 3rd millennium in Portuguese Extremadura. The results show the possible use of forage to feed the animals and also seem to indicate the use of fertilised fields. This demonstrates that animal production is already based on intentional practices of animal and land management, as well as on complex exchange networks.
- Animal management practices in the Western Iberian Peninsula during the Neolithic-Chalcolithic transition: the study case of Leceia site (Oeiras, Portugal)Publication . Navarrete, Vanessa; Cardoso, João Luís; Detry, CleiaThe principal aim of this work is to establish the degree of human control over the management and animal diet of domesticates and characterize different herding systems during the Neolithic-Chalcolithic transition in Leceia site.
- A multidisciplinary study of Iberian Chalcolithic dogsPublication . Blaschikoff, Ludmilla; Daza-Perea, Arantxa; Requicha, J. F.; Detry, Cleia; Rasteiro, Rita; Guimarães, Sílvia; Ureña, Irene; Serra, Octávio; Schmidt, Ryan; Valera, António Carlos; Almeida, Nelson J.; Porfírio, Eduardo; Santos, Ana Beatriz; Delicado, Cátia; Simões, Fernanda; Matos, José; Rosário, Isabel Amorim do; Petrucci-Fonseca, Francisco; Davis, Simon J. M.; Muñoz Merida, Antonio; Gotherstrom, Anders; Fernández-Rodríguez, Carlos; Cardoso, João Luís; Ginja, Catarina; Pires, Ana ElisabeteDomesticated dogs have been present in the Iberian Peninsula long before other domesticated species, back to the late Palaeolithic period. Their origin is still uncertain, but dogs were already well established during the Chalcolithic period (ca. 5000–4000 BP). This study employed a multidisciplinary approach comprising osteometric, radiographic and palaeogenomic analyses to characterize Chalcolithic Iberian Canis remains. Two Chalcolithic archaeological sites – Leceia, Oeiras, in Portugal, and El Caset´on de la Era, Villalba de los Alcores, Valladolid, in Spain – were the main focus of this study. Osteometric and odontometric data from eleven other sites in Iberia were also included. Osteometric results show signs of phenotypic variability, likely the result of human-driven selective pressure. Dental radiographic and dental wear analyses allowed age at death estimation for four individuals (two juvenile and two adults). Three Chalcolithic Iberian dogs had their mitogenomes resequenced and the mitochondrial DNA analysis allowed to assign each individual to two of the major known haplogroups – A and C. Molecular sex infered by the chromosomeX/chromosome1 coverage ratio allowed to identify one female and two males. This study unveils some aspects of the Iberian Chalcolithic dogs: these dogs already exhibited various morphotypes whose profiles might be associated to the performance of certain tasks, as well as mitogenomes of two distinct lineages that help tracking the evolutionary paths of Iberian dogs.
- Cozinhar e comer no Castelo Medieval de PalmelaPublication . Fernandes, Isabel Cristina F.; Cardoso, João Luís; Detry, CleiaA leitura da paisagem onde se insere o castelo de Palmela é, por si só, demonstrativa das potencialidades agro-pastoris, piscícolas e cinegéticas que beneficiariam as populações medievais. De facto, à planície que se estende a norte, antes em boa parte ocupada por matas com bons recursos de caça e marinhas de sal, acrescentava-se a qualidade dos solos e dos pastos das colinas e vales da Pré-Arrábida, sulcados por ribeiras afluentes do Sado e do Tejo, rios que definem a península interestuarina. Se juntarmos a estas generosas condições de subsistência as particularidades defensivas do morro do castelo e da estrutura militar aí construída em época islâmica, em articulação com outras fortificações e povoações importantes, como Coina-a-Velha, Alcácer do Sal e Lisboa, temos encontrados os factores primordiais de fixação de grupos humanos na região. A História e a Arqueologia têm vindo a demonstrar a veracidade desta constatação para o período medieval, entre os séculos VIII-IX e XIV. A ininterrupta ocupação dos espaços em referência, em épocas posteriores, decorre também de outras variáveis, que não cabe aqui explorar. O investimento na investigação arqueológica ao longo de mais de duas décadas, em prospecção e escavação no castelo, na área urbana de Palmela e na envolvente rural, tem dado os seus frutos, possibilitando um conhecimento acrescido do quotidiano dos habitantes intramuros, na vila e sobre a actividade campesina (Fernandes, 2004). A análise dos restos faunísticos encontrados nas escavações do Castelo de Palmela foi um contributo determinante para o estudo de alguns aspectos desse quotidiano, nomeadamente os relacionados com a alimentação das populações, a qual já deu origem a uma primeira publicação (Cardoso e Fernandes, 2012 ). Com a integração dos dados agora publicados, que abarcam uma amostragem mais numerosa - e que confirmam, nos seus traços gerais, as conclusões anteriormente apresentadas -, no restante arquivo arqueológico, tendo designadamente em consideração a tipologia das produções cerâmicas, pretendeu-se melhorar o conhecimento da alimentação no castelo de Palmela, entre os séculos VIII e XV, abarcando populações islâmicas (séculos VIII-XII) e cristãs (séculos XII -XV), através de um ensaio comparativo. São incluídos alguns dados para o período moderno, sem contudo se efectuar uma análise extensiva e representativa desse período.
- The curious case of the Mesolithic Iberian dogs: an archaeogenetic studyPublication . Pires, Ana Elisabete; Detry, Cleia; Chikhi, Lounes; Rasteiro, Rita; Amorim, Isabel R.; Simões, Fernanda; Matos, José; Petrucci-Fonseca, Francisco; Ollivier, Morgane; Hänni, Catherine; Cardoso, João Luís; Arias, Pablo; Diniz, Mariana; Araújo, Ana Cristina; Bicho, Nuno; Sousa, Ana Catarina; Moreno-García, Marta; Arruda, Ana Margarida; Fernández-Rodríguez, Carlos; Porfírio, Eduardo; Arnaud, José Morais; Valente, Alexandra; Gonçalves, David; Alves, Lara; Götherström, Anders; Davis, Simon J. M.; Ginja, CatarinaWe investigated the genetic, composition of six Canis remains from western Iberia, directly radiocarbon dated to 7,903-7,570 years (cal BP). They were identified as dogs via their qrchaeological and depositional context, osteometry, and a high percentage of aquatic diet shared with humans. For comparison, genetic data were obtained from an additional 37 Iberian dog remains from the Neolithic to Late Antiquity, as well as two Palaeolithic anda a Chalcolithic Canis identified as wolves. Previous data indicated that dog mtDNA haplogroup A (HgA) is prevalent in extant European dogs (>50%), in the Near East and Asia, but rare or absent (<10%) in European Canis older than 3,000 years (cal BP). We found a high frequency of dog HgA in pre-Neolithic Europe. We show that, contrary to the current view, Canis with HgA did not necessarily arrive in Europe from East-Asia. This phylogeographical difference in HgA frequency demonstrates that genetic differentiation was prior to, or as a consequence of, domestication which may be linked with pre-Neolithic local processes for Iberian wolf domestication. Our results emphasize that knowledge of both ancient wolves and early dogs genetic profiles from the European periphery should improve our understanding of the evolution of the European dog.